饮用水消毒臭氧发生器系统消毒时，需要根据饮用水水源和水质的分级状况进行常规净化（如絮凝、沉淀、氯化、臭氧过滤消毒）。

游泳池水消毒臭氧发生器的灭菌能力是氯气的2000多倍。臭氧在水中20分钟内会自行分解，因此，臭氧用于游泳池水消毒，无残留和二次污染。

二次供水消毒臭氧发生器用于藻类等微生物养殖水的净水处理。其原理是臭氧发生器通过高频高压电场将氧气转化为臭氧，再通过高频高压电场将氧气转化为臭氧，及时与水混合，及时与水混合，通过臭氧的强氧化作用杀灭水中的细菌。